13番ピンをGNDにつなぎ、4番をD+、6番をD-につなで、5VとGNDは基板から出ているところにつなぎました。写真左のUSB接続モジュールもいい感じです。

@tomonnn1 さんのちびでぃ〜の付属のATmega328P（MetaBoardブートローダ書き込み済み）をejackino-mini基板に乗せて使えるようにしてみました。